肛肠科为市级临床重点专科，现已成为本地区规模最大的肛肠专科，中西医结合肛肠病诊疗独具特色，疗效显著，在南通市肛肠专业处医疗中心地位。主要设立专科、专病、专症课题攻关组，完善专科人才梯队建设，使科室人才梯队和技术后备力量更趋合理，并形成显著的专科诊断、治疗优势：包括小剂量腰俞穴麻醉与术后镇痛；顽固性肛门坠胀研究；结肠传输试验与出口梗阻性便秘诊治；急性痔病的治疗；反复手术复发性肛瘘的手术与技巧；磁共振、腔内B超下多灶脓肿的定位诊断；复杂性肛瘘碘油造影；微创治疗的评估与规范等。

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